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Designação do projeto | PARADISE–
PARAsite Detection, ISolation and Evaluation
Código do projeto | 773830-PARADISE
Objetivo principal | O
projeto PARADISE está alinhado com um dos tópicos prioritários do consórcio:
tem um foco claro em agentes patogénicos transmitidos por alimentos com elevada
relevância a nível da União Europeia (Cryptosporidium
e Giardia) e usará abordagens de
sequenciação de nova geração (NGS) e não-NGS para fornecer esquemas de tipificação
e estratégias de enriquecimento inovadoras.
Região de intervenção | União
Europeia (Portugal, Itália, Suécia, França, Reino Unido, Paíse Baixos,
Dinamarca, Alemanha, República Checa) Entidade beneficiária | Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, I.P. (INIAV) Data da aprovação | 2019/09/19
Data de início | 2020/01/02 Data de conclusão | 2022-07-31 Custo total elegível | 40 202,50€ Apoio financeiro da União Europeia | 17 689,10€
Objetivos- Utilização da NGS para sequenciar novos genomas de Cryptosporidium e Giardia, fornecendo assim um conjunto de dados informativos de variabilidade
a nível europeu.
- Desenvolver metodologias de tipagem multi-locus para deteção e caracterização de genótipos/subtipos de Cryptosporidium e Giardia.
- Avaliar o desempenho das novas metodologias através de estudos
multicêntricos;
- Use a metagenómica como uma abordagem para a deteção de
protozoários e helmintas de origem alimentar em diferentes matrizes;
- Desenvolver estratégias não baseadas em NGS para melhorar a
sensibilidade da deteção, fornecendo métodos mais baratos aplicáveis às
matrizes alimentares, incluindo o enriquecimento seletivo de parasitas antes da
extração de DNA (aptâmeros e nanocorpos) e de amostras de DNA;
Atividades
- WP1 Coordenação e Gestão
do Projeto
- WP2 Metagenómica e
genómica baseada em NGS
- WP3 Desenho,
implementação e validação de esquemas de tipificação
- WP4 Estratégias de
enriquecimento
Resultados
Sequenciação de novos genomas de Cryptosporidium e Giardia; Desenvolvimento de novos esquemas de tipagem; Desenvolvimento de esquemas de proficiência multicêntricos para
avaliação dos esquemas de tipagem; Deteção de protozoários e helmintas em matrizes alimentares
utilizando metagenómica; Desenvolvimento de técnicas de enriquecimento de parasitas e DNA
de parasitas em matrizes alimentares;
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