O Laboratório de Microbiologia do Solo, possui uma coleção de bactérias fixadoras de azoto atmosférico, genericamente designadas por rizóbios (Rhizobium), cujo início data de meados dos anos 70 e da ex- Estação Florestal Nacional.

Atualmente tem cerca de 600 estirpes, na sua maioria bactérias autóctones portuguesas isoladas de nódulos de raízes de diversas espécies de leguminosas silvestres ou cultivadas, entre outras: trevos (Trifolium spp.), luzernas (Medicago sativa e espécies relacionadas), Lotus spp (L. corniculatus, L. uliginosus e L. parviflorus), tremoço (Lupinus spp.), grão-de-bico (Cicer arietinum), sulla (Hedysarum coronarium) e serradela (Ornithopus compressus).

O maior número de isolados corresponde aos de Trifolium spp. (250), seguidos pelos de lotus (200) e de luzernas (80).

Estas estirpes em coleção foram avaliadas quanto à fixação de azoto quando em simbiose com as leguminosas respetivas, propriedades fisiológicas, competitividade da nodulação e caracterizadas taxonomicamente por métodos moleculares. Atualmente estão armazenadas em frigoríficos, em frascos com meio específico para o seu crescimento (meio de manitol levedura com carbonato de cálcio) e também crio-preservadas em glicerol.